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温室白粉虱染色体水平基因组首次被揭示

2020-04-25 12:25:46来源:中国农业科学院蔬菜花卉研究所作者:曹柠
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    近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜虫害防控创新团队和美国康奈尔大学BTI合作解析了世界重大农业害虫温室白粉虱基因组,揭示了其发育特异性表达和抗药性分子机制。温室白粉虱基因组的解析对深入开展白粉虱功能基因组学研究、植物-昆虫-微生物及病毒互作、粉虱类害虫抗性治理应用均具有重要意义。相关研究在线发表于《分子生态资源(Molecular Ecology Resource)》。
    据谢文副研究员介绍,温室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum, n="11)和烟粉虱是世界上分布最广且危害最为严重的2种粉虱类害虫。烟粉虱基因组早在2016年和2017年由合作双方共同解析完成,但温室白粉虱基因组一直悬而未决。本研究中,利用三代测序平台Pacbio长reads和Hi-C技术,实现了白粉虱基因组染色体级别的组装。结果发现白粉虱基因组组装大小为787Mb,含11条染色体级别scaffolds(scaffold" N50长达70Mb);注释到18,275个蛋白编码基因,重复序列占基因组的56.6%;白粉虱发育阶段特异性表达分析找到一些和白粉虱蛹化和羽化有关联的基因,例如卵黄蛋白基因和cuticle基因;白粉虱和烟粉虱进化上的分化程度远远大于烟粉虱不同生物型之间;白粉虱和烟粉虱的比较基因组发现,天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有显着扩张,这可能和白粉虱所特有的寄主偏好有关;通过细胞色素P450家族的比较分析,在白粉虱找到和烟粉虱CYPCM1同源的4个P450基因,这4个基因有可能帮助到白粉虱代谢新烟碱类药剂。(通讯员 )
    原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1755-0998.13159

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